В структуре стационарного отделения выделены два дифференцированных по режиму содержания больных поста (на 25 и 35 коек), имеются клиническая лаборатория, процедурный кабинет, кабинет функциональной диагностики (электроэнцефалография, эхоэнцефалоскопия), кабинет групповой психотерапии, гипнотарий, кабинет семейного консультирования, кабинет социально-психологической помощи, кабинет физиотерапии, кабинет иглорефлексотерапии, кабинет  логопеда, кабинет трудотерапии, учебные комнаты для работы школы-больницы, игровые комнаты, вспомогательные помещения (административные, пищеблок и  т.п.), а также учебная аудитория кафедры психиатрии ВГМУ.

Стационарное отделение работает круглосуточно, оказывая специализированную медицинскую помощь детям до 15 лет, проживающим в г. Владивостоке и Приморском крае.

На  базе Детской психиатрической больницы открыто  два поликлинических отделения, в которых оказывается специализированная медицинская помощь детям и подросткам до 18 лет в амбулаторных условиях.

Поликлиническое психиатрическое отделение представлено кабинетами врачей-психиатров (по два  участка в  Ленинском, Первомайском, Первореченском районах, по одному  участку во Фрунзенском и Советском районах г. Владивостока). Кабинеты расположены в детских поликлиниках г. Владивостока. Один врач-психиатр работает в коррекционных школах-интернатах №1и №2.

Поликлиническое психотерапевтическое отделение представлено кабинетами врачей-психотерапевтов (по одному кабинету во всех районах города) и включает 5 кабинетов психопрофилактики. С целью приближения психотерапевтической помощи  к населению указанные кабинеты открыты в крупных районных детских поликлиниках. В них работают врачи–психотерапевты и медицинские психологи. В отделении есть социальный  работник, который организует мероприятия по социально-правовой защите пациентов. Психотерапевты и психологи проводят психопрофилактическую и психотерапевтическую работу с детским населением. В кабинетах психотерапии имеются возможности для проведения групповой и индивидуальной психотерапии. При необходимости используется специальное оборудование и помещения стационарного отделения КДПБ.